Doctor thứ Chín (Christopher Eccleston) tái sinh thành Doctor thứ Mười (David Tennant) trong phút cuối của tập "The Parting of the Ways"; Anh tự giới thiệu mình với bạn đồng hành Rose Tyler (Billie Piper) trong tập minisode Children in Need. Trong tập Giáng sinh năm 2005, Doctor sau khi tái sinh bị hôn mê trong suốt tập phim. Sau khi được Rose đánh thức, anh chiến đấu chống lại Sycorax và cứu Trái đất; trong lúc chiến đấu, anh bị chặt đứt một bàn tay, may thay cánh tay này mọc lại do năng lượng còn lại sau tái sinh. Doctor tiếp tục cuộc hành trình của mình trong phần 2 năm 2006, Doctor và Rose đã cứu Nữ hoàng Victoria (Pauline Collins) khỏi người sói, sự việc này vô tình lại tạo nên một tổ chức chống lại người ngoài hành tinh là Torchwood Institute. Doctor tiếp đó có dip gặp lại hai người bạn đồng hành cũ là nhà báo Sarah Jane Smith (Elisabeth Sladen) và chú chó robot K-9 (John Leeson). Câu chuyện kết thúc phần 2 diễn ra ở London hiện đại, tổ chức Torchwood vô tình khởi đầu cuộc chiến giữa chủng tộc Daleks khát máu và loài cyborg là Cybermen từ thế giới song song; việc cứu Trái đất của Doctor đã cướp mất Rose, cô bị bỏ lại ở thế giới song song, cùng với Mickey và mẹ cô trong tập "Doomsday".

Trong cảnh kết của tập "Doomsday", một cô dâu bí ẩn (Catherine Tate) bất thình lình xuất hiện trong buồng điều kiển của tàu TARDIS. Tập Giáng sinh năm 2006 Doctor cùng cô dâu hụt Donna Noble cứu thế giới khỏi Racnoss. Donna cứu Doctor khỏi việc sa lầy khi tìm cách báo thù loài Racnoss, đồng thời cô cũng từ chối làm bạn đồng hành.

Trong phần tiếp vào năm 2007, Doctor đón bác sĩ y khoa Martha Jones (Freema Agyeman) làm bạn đồng hành mới của anh. Cùng nhau, họ đã khám phá ra bí ẩn Face of Boe (Struan Rodger), ông tiên tri rằng Doctor "không hề đơn độc ("you are not alone.") Họ gặp lại Captain Jack Harkness (John Barrowman) trong chuyến du hành trong 3 tập tiếp theo, và chứng kiến kẻ thù tưởng chừng đã chết là Master (John Simm) quay trở lại và trở thành Thủ tướng Anh, Master đã bắt Doctor, hút hết năng lượng của anh và cầm tù anh.